Przykłady zastosowań:
Mamy dwa pliki wejściowe: a.dat (6 linii) i b.dat (4 linie):

# to jest plik a.dat
# obliczenia dla E= 0.12  Sigma= 8
# x y z
1.1 12.21 -9
2.2 22.23 -8
3.4 34.34 -7

# plik b.dat, dla E= 0.13  Sigma= 9
1.11 112
2.2  256
3.40 301

Przykładowe operacje na nich:
--> zebrać wszystkie linie razem:
'filtertool -i a.dat,b.dat' lub 'filtertool -i a.dat,b.dat -j'

1.1 12.21 -9
2.2 22.23 -8
3.4 34.34 -7
1.11 112
2.2  256
3.40 301

--> wybrać linie z wartością > 30 w drugiej kolumnie:
'filtertool -i a.dat,b.dat -f 2,gt30,0,1,2,3'

3.4 34.34 -7
1.11 112
2.2  256
3.40 301

--> wypisać 2 kolumnę z linii o wartości w pierwszej kolumnie równej 3.4:
'filtertool -i a.dat,b.dat -f 1,eq3.4,0,2'

34.34
301

--> wypisać wartości z 2-ej kolumny zebrane wg wartości w 1-ej kolumnie:
'filtertool -i a.dat,b.dat -p 1,2 -g 1'

1.1 12.21 --
1.11 112 --
2.2 22.23 256
3.4 34.34 301

--> wypisać wartości z 1-ej kolumny zebrane wg kolejności wystąpienia:
'filtertool -i a.dat,b.dat -g f -p 1,4'

1.1 1.11
2.2 2.2
3.4 3.40

--> wypisać 2-gą kolumnę podając wartość parametru E w pierwszej, pod warunkiem, że wartość w 1-ej kolumnie jest z zakresu 2.0 a 3.0:
'filtertool -i a.dat,b.dat -p 1,E,2 -f 1,ge2.0,a,le3.0,2,3'

0.12 22.23
0.13 256

--> wypisać wartość parametrów E i R, bez wypisywania żadnych kolumn:
'filtertool -i a.dat,b.dat -p E,Sigma'

0.12 8
0.13 9

--> wypisać sumę, średnią i liczbę danych branych z 2-ej kolumny zebrane wg wartości w 1-ej kolumnie:
'./filtertool -i a.dat,b.dat -p 1,2 -g 1 | ./filtertool  -p 2,3 -c s,a,c | ./filtertool -p 3,4,5'

12.21  12.21  1
112    112    1
278.23 139.12 2
335.34 167.67 2

--> zamienić kolumnę 1-szą i 2-gą w plikach *.dat - wynikiem mają być zmienione pliki a.dat i b.dat:
'filtertool -i a.dat,b.dat -s 1,2 --comments all -o a.dat,b.dat'

# to jest plik a.dat
# obliczenia dla E= 0.12  Sigma= 8
# x y z
12.21 1.1 -9
22.23 2.2 -8
34.34 3.4 -7

# plik b.dat, dla E= 0.13  Sigma= 9
112 1.11
256 2.2
301 3.40

--> filtertool -i a.dat,b.dat -m

#filtertool -i a.dat,b.dat -m
#Mon Aug  3 15:24:07 2009

# Data from files: a.dat, b.dat
1 1.1 12.21 -9
1 2.2 22.23 -8
1 3.4 34.34 -7

2 1.11 112
2 2.2 256
2 3.4 301